Một quả trứng mới đẻ có lớp phủ ẩm tự nhiên gọi là “bloom”, có tác dụng giúp bịt kín và bảo vệ trứng khỏi sự xâm nhập của vi khuẩn. Nếu quả trứng này được rửa, lớp màng bloom sẽ biến mất và vỏ trứng dần trở nên xốp, dễ bị tổn thương hơn.
Vi khuẩn salmonella thường được tìm thấy trên vỏ của trứng tươi. Đây là loại vi khuẩn có thể gây buồn nôn, đau dạ dày, tiêu chảy và tệ hơn là sốt. Đó đồng thời cũng là triệu chứng mà những người thường ăn trứng sống, trứng nấu chưa chín hoặc các sản phẩm làm từ trứng bị nhiễm khuẩn gặp phải.
Vào những năm 1970, do lo ngại về vấn đề vệ sinh, Bộ Nông Nghiệp Mỹ đã yêu cầu các nhà sản xuất và chế biến trứng quy mô lớn phải có quy trình rửa, vệ sinh và làm lạnh trứng ngay lập tức. Tương tự là Canada, Nhật Bản, và một số nước Bắc Âu.
Tuy nhiên, ở hầu hết các quốc gia thuộc Liên minh châu Âu, nhà sản xuất không được phép rửa hoặc làm lạnh trứng, ngay cả trong các cửa hàng. Người châu Âu tin rằng trứng vốn đã được bảo vệ tự nhiên khỏi vi khuẩn nhờ vào sự vẹn nguyên của lớp vỏ, và có thể bảo quản tự nhiên trong nhiều ngày.

Ngoài ra, nhiều quốc gia cũng yêu cầu người chăn nuôi tiêm vắc-xin cho gia cầm để tránh việc trứng nhiễm khuẩn salmonella. Vì lý do này, không ít hộ chăn nuôi nhỏ lẻ thường bán trứng ngay khi mới được thu hoạch từ trang trại mà không phải qua công đoạn làm sạch. Họ tin rằng những yếu tố tự nhiên của trứng đã giúp bảo vệ an toàn khỏi vi khuẩn, miễn là bạn không tẩy sạch vỏ trứng.
Tuy nhiên, nghiên cứu của Cơ quan Nghiên cứu Nông nghiệp Georgia, đã chỉ ra rằng lớp màng bloom bao học vỏ trứng sẽ thoái hóa nhanh chóng, khô và bong ra sau khi quả trúng tiếp xúc với môi trường bên ngoài. Do đó, bảo quản lạnh vẫn sẽ là phương pháp tối ưu nhất, không chỉ bảo vệ trứng khỏi vi khuẩn, mà còn giúp duy trì chất lượng của trứng.
Các nhà nghiên cứu đã xem xét 5.400 quả trứng và thấy rằng những quả được rửa và bảo quản trong tủ lạnh vẫn là trứng loại A (chất lượng rất cao) sau trung bình 15 tuần. Những quả được lưu trữ ở nhiệt độ phòng xuống cấp chất lượng nhanh hơn, từ loại A (chất lượng cao nhất) đến Loại B (chất lượng thấp nhất) chỉ trong 1 tuần. Đồng thời trọng lượng của những quả trứng này cũng giảm 15% sau 15 tuần.